Un sistema de archivos es un método para el almacenamiento y organización de archivos de computadora y los datos que estos contienen, para hacer más fácil la tarea encontrarlos y accederlos. Los sistemas de archivos son usados en dispositivos de almacenamiento como discos duros y CD-ROM e involucran el mantenimiento de la localización física de los archivos.

Más formalmente, un sistema de archivos es un conjunto de tipo de datos abstractos que son implementados para el almacenamiento, la organización jerárquica, la manipulación, el acceso, el direccionamiento y la recuperación de datos.

RUTAS Y NOMBRES DE ARCHIVOS (LINUX )

Linux organiza ficheros y carpetas en un estructura de árbol. Un fichero está siempre en una carpeta, y una carpeta puede contener ficheros y subcarpetas. La carpeta de más alto nivel en esta jerarquía en Linux siempre tiene el nombre “/”. Cuidado con la inclinación de esta barra, pues “\” tiene otro significado diferente.

Todo fichero o carpeta tiene una ruta absoluta que es la secuencia de carpetas que se atraviesan desde la raíz separadas por el símbolo “/” y que termina con su propio nombre. Por ejemplo, /dirA/dirB/dirC/fichero.txt es la ruta absoluta del fichero fichero.txt almacenado en la carpeta dirC que a su vez está contenida en la carpeta dirB, a su vez contenida en la carpeta dirA almacenada en la raíz del sistema de ficheros. El programa konsole que abre la ventana con el intérprete está configurado para mostrar la ruta absoluta del directorio actual en la barra de título de la ventana

Además de las carpetas y ficheros creados por el usuario o los programas, toda carpeta Linux tiene dos subcarpetas definidas por defecto:

• “..”: Es la carpeta del nivel superior en la jerarquía de ficheros que contiene a esta. Esta subcarpeta también esta presente en la raíz del sistema de ficheros (la carpeta con ruta absoluta “/”), pero apunta a si misma.
• “.”: Es la propia carpeta que aparece como si fuese también una subcarpeta. Se puede considerar como una “autoreferencia” o apuntador a si misma. 
  
  Estas carpetas son a todos los efectos carpetas normales en el sistema; es decir, se pueden utilizar en las rutas. Por ejemplo, la ruta /dirA/dirB/dirC/../fichero2.txt se refiere al fichero que está almacenado en la carpeta dirB, pues desde dirC, la carpeta .. apunta a su predecesor, dirB. La siguiente figura muestra la interpretación de esta ruta así como el equivalente de las carpetas “..” y “.”.
  
  RUTAS Y NOMBRES DE ARCHIVOS (WINDOWS)

EXTENSION DE ARCHIVO

En informática, una extensión de archivo o extensión de fichero, es una cadena de caracteres anexada al nombre de un archivo, usualmente precedida por un punto. Su función principal es diferenciar el contenido del archivo de modo que el sistema operativo disponga el procedimiento necesario para ejecutarlo o interpretarlo, sin embargo, la extensión es solamente parte del nombre del archivo y no representa ningún tipo de obligación respecto a su contenido.

Algunos sistemas operativos, especialmente los herederos de DOS como Windows, utilizan las extensiones de archivo para reconocer su formato, incluyendo el de archivos ejecutables. Otros sistemas operativos, como los basados en Unix, utilizan las extensiones de archivo por simple convención, no necesariamente utilizándolas para determinar su tipo.

Siendo las extensiones de archivo legado del sistema DOS, muchas de sus actuales características fueron heredadas por limitaciones en dicho sistema. Los antiguos sistemas DOS limitaban la cantidad de caracteres de la extensión de archivo a tres, por lo que muchas extensiones convencionales poseen esa cantidad de caracteres. Además, los nombres de archivo en sistemas DOS son insensibles a las mayúsculas y minúsculas, por lo que la mayoría de las extensiones de archivo pueden ser escritos indiferentemente en minúsculas como en mayúsculas o una combinación de ambas.

fuentes de informacion:
http://www.alegsa.com.ar/Dic/sistema%20de%20archivos.php
http://www.tldp.org/pub/Linux/docs/ldp-archived/system-admin-guide/translations/es/html/ch06s08.html